然后进入讲堂，主要人物按主客、按长序分东西两侧坐于讲台蒲团之上，听讲者则盘膝坐于台下，先由礼赞领诵门派经典
段，然后当值者点起线香，众人静坐默思。待线香燃尽后，方才由本日主讲人授讲，然后是自由提问
之处、查名实之理、处利害、决嫌疑；摹略万物之然，论求群言之比。’其核心在于探究万物相关之原因。
实心学认为，学者之所以辩论不能明是非，分胜负，乃至得出真理，就是因为缺乏逻辑，从而出现种种诡辩混淆视听。只有逻辑才能扫除诡辩
迷雾，纠正悖论错误，引导人们获得真知。
所以入琼林学派第课，就是学习逻辑，没有通过逻辑学测试，就不许开口论经。而学者所出每言，都必须符合逻辑，如果出现前后矛盾、自相矛盾，或者与实际矛盾，则必须承认错误，并在段时间内保持缄默，重新审视自己学说逻辑。
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实心学创立，第次为身怀‘修齐治平’，却深感迷茫无助中国文人，指出
条明路。是以经问世，便吸引到信者无数，尤其是那些胸怀大志热血青年，几乎轻易就摒弃原先所学，加入琼林学派。
而实心学‘三百六十行，即可出圣贤’开放态度，又吸引大量平民百姓，工商业者加入进来。短短数年，琼林学派便发展壮大起来，尤其是在东南，几乎每个州县，都有其讲学之处。只是因为吸取王学鱼龙混杂，作*犯科者众多教训，琼林学派建立严格戒律。在孙鑨所制定《会约》中，提出二十四条读书讲学要求。
其中‘四要’，是加入琼林学派目。‘二惑’，是指在会中学习应持态度。‘九益’是读书讲学九大好处。而‘九损’则是有害于读书讲学九种行为，也是琼林学派戒律：
所谓比昵狎玩，鄙也；党同伐异，僻也；假公行私，贼也；评议是非，浮也；谈论琐怪，妄也；文过饰非，怙也；多言人过，悻也；执是论辩，满也；道听途说，莽也。违反这些戒律，会遭到学派惩罚，严重直接驱逐。
除戒律之外，还有严格仪式。由褚大绶制定《会约仪式》十条，规范集会讲学仪式。比如孙鑨在崇正书院首次讲学情形，就是最好说明。
在开会前天，书院山长已经恭恭敬敬地捧着孔子和孟子圣像，将其挂在讲堂。这日仪式举行时，先击鼓三通，所有与会者穿戴整齐，在圣像前行四拜礼，再到供奉着墨子、朱熹、阳明先生和白云先生四贤牌位前行礼。
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