、失眠和心律不齐。因为无法准确获知咖啡中
咖啡因含量，英国民众仍对咖啡心存芥蒂。
可可树可能是为
抵御那些爱吃树叶动物才演化出生成大量咖啡因机制，因而树叶中咖啡因含量最高，也为可可树赢得生存空间播散开来。那些爱吃可可树叶并对其中咖啡因上瘾动物频频光顾，啃食叶片，并将树种传播。遗传学家最近发现可可树和人类有
个重要共同特征：基因。可可树蛋白质编码基因数量（2.5万个）比人类还多（约2万个），这应该能让人们对咖啡演化心生敬佩，或者不再以造物宠儿自居。[324]
不时仍有不同品种咖啡中含有致癌物以及烘焙过程中会产生致癌物报道。[325]咖啡因只是咖啡豆所含上千种化合物中种，而烘焙过程会生成更多物质。网络上许多报道焦点是其中单种成分，这会对人们产生误导。阿拉伯咖啡中含有至少12种多酚，其中种名为氯原酸（chlorogenicacid，又名咖啡单宁酸），听起来似乎和消毒游泳池漂白粉关联更密切。不过，根据现有证据，研究人员认为这些多酚类物质和可可、橄榄中多酚样，尽管名字听起来像有毒化学物质，但实际上都有益健康。
双胞胎试验表明，和许多其他食物样，对咖啡喜好与遗传影响关系很大。[326]部分可能与味觉基因有关，不过与另个研究团队合作开展项针对基因相关性荟萃分析显示，这喜好是由另种专有基因决定，这种基因调控咖啡及其中上千种化合物在肝脏中代谢过程。食用些成分复杂食物之后感到愉悦或糟糕，也是由酶分解食物生成产物决定。也就是说，同样食物会给人带来不同感受。[327]
除上千种化合物和数十种有抗氧化作用多酚，咖啡纤维素含量也很高，每杯咖啡中含0.5克。纤维素和多酚组合意味着咖啡也可以为肠道细菌提供养份。[328]肠道菌分解纤维素生成丁酸盐等短链脂肪酸，促进有益拟杆菌和普雷沃氏菌生长。[329]因此早晨喝杯咖啡可以唤醒体内微生物，而且这功效不是仅仅由咖啡因实现。
如果你不喜欢喝意式浓缩等浓咖啡呢？要摄入足量多酚，在美国你可能需要喝大杯咖啡，只要多酚含量相当，不管喝是无咖啡因咖啡还是冻干速溶咖啡，对肠道微生物都有同样好处。茶叶则没有同样健康益处。尽管茶叶中也含有多酚，但不含纤维素，
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